Hoofdpijn en migraine kunnen ontstaan door een combinatie van meerdere factoren, zoals o.a. omgeving, voeding en genetische factoren. Genetische factoren spelen over het algemeen maar een beperkte rol bij de ontwikkeling van hoofdpijn en/of migraine. Er zijn echter migrainevormen, zoals familiaire hemiplegische migraine, waarbij genetica een zeer grote rol speelt.